Анимационный фильм «Супермен/Бэтмен: Апокалипсис» продолжает историю, начатую в «Врагах общества». Казалось бы, крупнейшая угроза миру нейтрализована, а политический скандал разрешён. Однако один из осколков разрушенного криптонитового астероида всё же достигает Земли, опускаясь в воды Готэмского залива. Расследуя происхождение обломков, Бэтмен сталкивается с попыткой угона своего катера.
На затерянном острове, скрытом от мира, живут амазонки — воительницы, descendants древних богов. Их тюрьма для Ареса, бога войны, была нарушена, когда военный самолёт потерпел крушение у их берегов. Пилот, единственный выживший, становится причиной событий, которые заставят принцессу Диану выйти из изоляции.