Фильм «G. I. Joe. Бросок кобры: Снейк Айз» погружает в истоки легенды, рассказывая предысторию одного из самых загадочных бойцов элитного отряда. Мы видим, как бездомный и беспризорный боец, чья жизнь — это череда жестоких уличных схваток, неожиданно получает шанс на новое начало. Спася наследника могущественного японского клана Арасикагэ, он вступает в их закрытый мир, где его учат древним...
Маргарет, молодая американка, приезжает в Токио, пытаясь оставить позади тяжёлые воспоминания и начать жизнь с чистого листа. Днём она преподаёт английский, а ночью теряется в лабиринте столицы Японии — в шумных барах, тёмных переулках и отелях любви, где каждый вечер приносит новые, всё более экзотические впечатления.