Фильм «Бунраку» переносит зрителя в фантазийный мир, где архитектура и атмосфера напоминают живую комикс-страницу и театр марионеток бунраку. Действие разворачивается в изолированном городе, который десятилетиями живёт по законам жестоких кланов. Сюда, скитаясь по пустыне, прибывает таинственный бродяга без памяти, чьё прошлое скрыто в тумане.
Нью-Йорк, в котором когда-то кипела жизнь, превратился в мёртвый город, опустошённый загадочным вирусом, который уничтожил почти всё человечество и превратил выживших в агрессивных мутантов, боящихся солнечного света. Единственный человек, у которого есть иммунитет к заболеванию, — учёный Роберт Невилл, который днём пытается докопаться до причин эпидемии и создать вакцину, а ночью отбивается...