Знакомый по 'Шреку' персонаж, отважный и обаятельный Кот в сапогах, становится главным героем собственной истории, которая раскрывает его прошлое и амбиции. Жажда славы и приключений заводит его в компанию хитроумного Шалтай-Болтая и ловкой воровки Кисы. Вместе они замышляют невероятно рискованное ограбление — похищение знаменитой Гусыни, чьи золотые яйца способны изменить судьбы.
Когда весь мир следит за подготовкой к конклаву — выборам нового Папы Римского, в стенах Ватикана происходит серия жестоких ритуальных убийств высокопоставленных кардиналов. Каждое преступление сопровождается загадочным символом, указывающим на связь с давно истребленным тайным братством Иллюминатов, которое в Средние века противостояло католической церкви.